जल जीवन मिशन की जांच में, सीबीआई को कई और मामले भी मिल सकते हैं। वित्त विभाग के अधिकारियों ने पहले यह पैसा राज्य सरकार की संचित निधि में जमा करने की बजाय सीधे RWSSC के खातों में डाल दिया था। इसके बावजूद, जब भी RWSSC से पैसा निकाला गया, यह सीधे जल जीवन मिशन के खातों में जाता था। CAG ने इस पर अनुमति के बिना यह कार्रवाई करने के बारे में बार-बार चेतावनी दी थी।
वित्त विभाग ने सीबीआई को RWSSC के खातों के मामले को ठंडा करने के लिए पत्र लिखा, लेकिन सीबीआई ने यह कार्रवाई स्वीकार नहीं की। सीबीआई ने कहा कि जल जीवन मिशन के लिए राशि को सीधे RWSSC के खातों में ट्रांसफर करने से इसे संचित निधि का हिस्सा नहीं बनाया जा सकता, और न ही इसे विधानसभा की मंजूरी के बिना खर्च किया जा सकता।
